No lleva ni un mes al frente de la compañía, ya que fue designado como presidente de la misma el 2 de diciembre en sustitución de Pablo Vázquez. Juan Alfaro es un gran conocedor del transporte terrestre, pues desde 2012 ha desempeñado el puesto de director general de la Sociedad Estatal de Infraestructuras del Transporte Terrestre. Sus dos primeras decisiones han sido muy rápidas y han contado con el beneplácito del ministro de Fomento, solucionando dos temas que coleaban: finalizar de una vez el concurso para la adquisición de nuevos trenes para Renfe, con la contratación de los mismos a Talgo, y apoyar el retraso de la liberalización del transporte de pasajeros hasta 2020.